新技术可以在单个组织样本中标记各种分子
一项新技术可以标记各种分子并放大信号,以帮助研究人员发现那些特别稀有的分子。哈佛大学Wyss研究所的Peng Yin实验室去年将这种方法称为SABER(通过交换反应进行信号放大),并从此找到了将其应用于蛋白质,DNA和RNA的方法。Yin将在2月18日星期二于加利福尼亚州圣地亚哥举行的第64届生物物理学会年会上解释包括SABRE在内的DNA纳米技术如何帮助科学家分析分子景观。

要了解我们的身体在细胞和分子水平上如何正常运作或在疾病期间如何运作,必须可视化一系列分子。当前有这样做的方法,但是每种方法都有其局限性。很难看到低丰度分子,当连接单个荧光探针时,它们会发出微弱或不可检测的信号。同时看到许多分子或寻找大型和复杂的组织样本中不常见的分子(如肿瘤活检)也具有挑战性。这些局限性激发了Peng Yin设计和开发新的纳米技术的灵感。
为了使用SABRE来检测蛋白质,Yin及其同事将短的DNA手柄连接到抗体上。抗体与蛋白质特异性结合,然后SABER过程可以以分支模式添加DNA序列以添加荧光分子。他们将这项技术命名为免疫SABER。与标准免疫荧光不同,在标准样品中通常只能在同一样品中标记五种蛋白质,通过将免疫SABER与DNA交换方法偶联,它们可以在同一视网膜样品中标记十种蛋白质。SABRE是一种纳米技术,采用可附着到目标分子的定制DNA模板。每个DNA模板还具有添加荧光探针的靶标,可以将其设计为具有分支模式以容纳更多的荧光探针,从而使检测稀有分子更加容易。在SABER技术的首次演示中,Yin及其同事针对了小鼠视网膜中的DNA和RNA序列,并同时在人类X染色体上可视化了17个不同的目标区域。这是对传统方法(称为FISH(荧光原位杂交))的重大改进,该方法难以检测稀有序列,特别是在厚组织中,很难检测到稀有序列,并且仅限于一种荧光探针。
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