研究人员在海水中使用DNA来监测扇贝繁殖
缅因大学和Bigelow海洋科学实验室的研究人员开发了一种方法,通过分析水样中发现的环境DNA来研究扇贝产卵的时间。
这项新发表的研究提供了一种管理野生和养殖贝类种群的工具,它证明了新兴的eDNA方法有望用于监测所有海洋生物的存在和活动。
“了解海洋生物何时何地产卵对于了解其种群增长和生命周期非常重要。通常,监测海洋无脊椎动物(包括海扇贝)中的产卵事件可能是一项艰巨的任务,因此能够通过抽取海水来追踪这些事件可能是非常重要的。有益于海洋物种管理和保护实践,“主要作者Skylar Bayer说,他是一名UMaine毕业生,现在是NOAA东北渔业科学中心康涅狄格州米尔福德实验室的博士后研究员。
许多海洋生物是广播产卵者,这意味着为了繁殖,它们将微小的生殖细胞,精子和卵或配子释放到水中。研究人员表示,这些释放或产卵事件的实时检测很困难,几乎不可能将水样中的配子追溯到使用传统显微镜方法释放它们的物种。
该项目中使用的基于DNA的定量聚合酶链式反应(PCR)方法通过分析海水样本中的大西洋海扇贝(Placopecten magellanicus)特有的DNA片段,避免了历史障碍。这使研究人员能够获得有关产卵事件的存在和程度的数据。
“定量PCR是一种非常敏感的方法,可以让我们检测特定的生物体,即使在水样中可能只有一些基因拷贝,”Bigelow实验室的高级研究科学家Pete Countway说道,他的合着者是研究。“这非常令人兴奋,因为这种方法几乎适用于任何广播产品。”
Countway专注于利用分子和基因组技术研究微观海洋生物的生态学,该项目将这些方法从微生物学应用于更大的商业价值物种。
这项工作建立在海洋科学学院的研究教授,UMaine龙虾研究所所长Rick Wahle的合作作者Rick Wahle的基础上,对广播产卵者的生殖生态进行了20年的研究。
“这个项目是第一个;它现在证明了在近乎实时的情况下理解广播产卵群体(包括蛤蜊,珊瑚和鳕鱼)产卵事件的可能性,这项任务历史上需要花费数周时间才能进行大量评估,并且仅在后见之明,“瓦勒说。
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