导读 使用WGS，病原体的完整DNA代码可以在几分钟内从食物样本上传到名为GenomeTrakr的国际公共数据库。结果是精确的数据集，其将例如单核细胞增
使用WGS，病原体的完整DNA代码可以在几分钟内从食物样本上传到名为GenomeTrakr的国际公共数据库。结果是精确的数据集，其将例如单核细胞增生李斯特菌的特定菌株瞬间连接回其原始来源。
通过比较以前在GenomeTrakr中输入的信息和食物中发现的病原体和/或WGS，WGS有能力帮助我们解决更多疾病爆发，将病人与可能的食物来源联系起来，并确定李斯特菌的新食物来源，如冰淇淋和焦糖苹果。环境。
自2013年以来，美国食品和药物管理局(FDA)与国家生物技术信息中心(NCBI)，疾病控制和预防中心(CDC)，欧洲分子生物学实验室(EMBL)，DNA数据库(DDBJ)合作以及一个公共卫生实验室网络，用于收集和储存GenomeTrakr中有关食源性病原体的大量基因组和地理数据。世界各地科学家的目标是确定食品中存在的每种病原菌，病毒和寄生虫的完整DNA谱，如李斯特菌，沙门氏菌，大肠杆菌，弯曲杆菌和弧菌，以对抗食源性疾病。
随着我们收集更多关于食源性病原体的数据，我们将更好地了解食物如何掺假以及如何确定污染的根本原因。WGS的直接，廉价和高度准确的测试程序正在成为食品安全未来的黄金标准。
虽然这项技术可以提供对食源性病原体的快速了解，但从农场到餐桌的整个食品行业应继续致力于实施最高水平的良好生产规范(GMP)以防止污染。
标签： 全基因组测序
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