大白菜是作物家族的一部分,必须暴露在低温下一段特定的时间才能开花。科学家成功地全面鉴定了大白菜暂时暴露在寒冷的温度下四周时所表达的长链非编码核糖核酸(IncRNA)。已知与拟南芥感冒有关的LncRNAs在大白菜中不存在,这表明大白菜具有其独立的开花机制。
研究小组由Namiko Nishida(神户大学农业科学研究生院)和Daniel Shea(新泻大学科学技术研究生院)领导。该团队还包括副教授Ryo Fujimoto(神户大学农业科学研究生院),Keiichi Okazaki教授(新泻大学理工学院),团队负责人Motoaki Seki(RIKEN可持续资源科学中心),国家农业研究员和食品研究组织(NARO)和澳大利亚联邦科学与工业研究组织。该研究结果于6月26日在科学报告的在线版上发表。
非编码RNA缺乏产生蛋白质所需的信息。这些非编码RNA分为小RNA(约20个核苷酸长)和长非编码RNA(IncRNA,超过200个核苷酸长)。LncRNA在大多数植物中表达,已知数万株在模拟植物拟南芥中表达。
LncRNA与春化现象有关:当植物需要暴露于冷处理时才开花。这种现象可见于芜菁(Brassica rapa L.)的许多亚种,包括大白菜,它在冬季生长,在春季开花
研究小组从22℃栽培2周的大白菜叶中提取总RNA,在室温下培养大白菜叶2周,然后在低温(4℃)下再培养4周。使用RNA测序,他们获得了足够的信息来识别暴露于低温后IncRNA表达的变化。
当研究小组调查由低温诱导的mRNA(信使RNA)表达模式时,转录结构域与incRNAs(内含RNA,一种IncRNA)和NATs(天然反义转录本,另一种类型的IncRNA)重叠,他们发现了类似的表达模式但没有发现与春化的强烈联系。然而,他们发现mRNA和NAT的组合在低温下显示相同的表达改变(图2),表明NAT与冷处理下mRNA表达的变化有关。
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