LSTM的研究人员与来自剑桥Wellcome Sanger研究所和牛津大学大数据研究所的同事一起使用全基因组测序来了解疟疾蚊子中的拷贝数变异体(CNVs)及其在杀虫剂抗性中的作用。
许多疾病，如疟疾，寨卡病毒和登革热病，都是由蚊子传播的，使控制蚊子种群成为解决这些疾病的基石。这通常通过使用杀虫剂来实现，传统上效果很好。发表在Genome Research期刊上的论文的第一作者埃里克卢卡斯博士解释说：“过去20年来，疟疾病例已大大减少，这主要是由于病媒控制得到了改善。但这些努力受到抗药性进展的威胁。为了更好地理解和解决杀虫剂抗性，我们需要了解导致它的基因突变，但到目前为止只发现了一些突变。“
为了更好地了解抗药性的演变，LSTM以及牛津大学和惠康桑格研究所的合作者正在对来自撒哈拉以南非洲地区的数千名主要疟疾蚊子冈比亚按蚊的基因组进行测序。一个名为An的项目。冈比亚1000 Genomes项目(Ag1000G)。
可能导致杀虫剂抗性增加的一种突变是获得额外的基因拷贝，这些基因有助于分解蚊子体内的杀虫剂，但对疟疾蚊子中此类拷贝数变异体(CNVs)的研究却很少。对于这项工作，该团队使用Ag1000G数据来查找An中拷贝数的增加。冈比亚发现CNV更可能发生在杀虫剂抗性发挥作用的基因中，而不是其他基因组。“在我们的研究中，几乎每个人都发现了这些与抗性相关的CNV，”卢卡斯博士继续说道，“超过90%的蚊子在一些人群中的拷贝数增加。总体而言，在已知与之相关的五个遗传区域中在冈比亚冈比亚的杀虫剂解毒，我们发现了44种不同的CNV。
LSTM矢量生物学系主任Martin Donnelly教授是该论文的高级作者。他说：
这项研究证明了基因拷贝数增加对杀虫剂抗性演变的重要性，并且应该促进对理解每种CNV及其作用的杀虫剂的确切作用的研究。一旦了解了这些影响，测试这些突变的存在并追踪它们在种群间的传播将有助于我们预测蚊子种群可能仍然易受影响的杀虫剂。
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